home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ The Arsenal Files 6 / The Arsenal Files 6 (Arsenal Computer).ISO / health / med9605a.zip / M9650027.TXT < prev    next >
Text File  |  1996-03-09  |  2KB  |  35 lines
  1.        Document 0027
  2.  DOCN  M9650027
  3.  TI    HIV-1 protease specificity derived from a complex mixture of synthetic
  4.        substrates.
  5.  DT    9605
  6.  AU    Kassel DB; Green MD; Wehbie RS; Swanstrom R; Berman J; Glaxo-Wellcome
  7.        Research Institute, Research Triangle Park, North; Carolina 27709, USA.
  8.  SO    Anal Biochem. 1995 Jul 1;228(2):259-66. Unique Identifier : AIDSLINE
  9.        MED/96171046
  10.  AB    A rapid and semiquantitative method is described for determining the
  11.        relative kcat/Km for individual peptides in defined substrate mixtures.
  12.        The method utilizes electrospray ionization/mass spectrometry alone to
  13.        semiquantitatively determine relative peptide substrate turnover rates.
  14.        Unlike previous studies, in which chromatographic separation of
  15.        individual peptide species was required, this mass spectrometric-based
  16.        method relies strictly on the ability to ionize and detect
  17.        simultaneously all peptide species in a defined mixture. Differences in
  18.        the ion intensities of the individual components before and after
  19.        incubation with protease are used to semiquantitatively determine
  20.        preferred substrates. This method was used to the identify preferred
  21.        peptide substrates for HIV-1 protease. Optimal substrates were
  22.        identified from a defined synthetic peptide substrate mixture based on
  23.        Ser-Gln-Asn-Tyr-Pro-Ile-Val, where the P1' proline was substituted with
  24.        20 naturally occurring amino acids. The hydrophobic residues Leu, Ile,
  25.        Val, Phe, and Tyr were preferred in addition to Pro at the P1' site. The
  26.        results were corroborated by performing the more laborious
  27.        HPLC/Frit-fast atom bombardment/MS analyses.
  28.  DE    Amino Acid Sequence  HIV Protease/*METABOLISM  Mass Fragmentography
  29.        Molecular Sequence Data  Molecular Weight  Substrate Specificity
  30.        Support, U.S. Gov't, P.H.S.  Time Factors  JOURNAL ARTICLE
  31.  
  32.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  33.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  34.  
  35.